Así fue como el paisaje se fue transformando, los campos se alambraron, los bosques y palmares dejaron lugar a los cultivos y la fauna silvestre fue desplazada por los animales domésticos. Pero entre los pobladores se destacó uno de origen europeo, que había heredado de su padre un campo. Era un joven abogado aficionado a la botánica que recorría el mundo estudiando plantas y que con el tiempo se convirtió en una autoridad mundial en la materia. Sin abandonar sus compromisos en Dinamarca, que era su tierra natal, se instaló en su campo de Corrientes dedicándose a su vocación. Su nombre era Troels Myndel Pedersen. En el año 1988 le comunicó al presidente de Parques Nacionales que tenía interés en legar sus Estancias Santa Teresa y Santa María, donde siempre se había ocupado de mantener los ambientes naturales. Luego de muchas idas y vueltas, en noviembre de 1991, se formalizó la donación de las tierras por parte del Dr. Pedersen y su señora esposa a la Nación Argentina, bajo la expresa condición de que fueran destinadas a la instalación de un Parque Nacional. En ese mismo año el directorio de la APN acepta la donación y comienzan las gestiones ante las autoridades provinciales, logrando en junio de 1995 la cesión de jurisdicción a la Nación de las tierras involucradas en el proyecto. El Parque Nacional Mburucuyá es el primero de la provincia de Corrientes y fue creado por Ley 25447 el 28 de junio de 2001.
El paisaje es en su mayor parte llano y presenta un vistoso mosaico de ambientes. Por el norte, en las partes altas, hay densos quebrachales de Quebracho Colorado Chaqueño y palmares de Palma Blanca, con pastizales inundables que ocupan los bordes de los esteros. En la zona central encontramos lagunas casi perfectamente circulares, rodeadas de bosques húmedos. Estos representan a la más norteña Selva Misionera, que alcanza estas regiones en forma de isletas o capones. También se hallan extensos pastizales con palmares de Yatay, la misma palmera que se encuentra en el P.N. El Palmar, provincia de Entre Ríos y bosques bajos y espinosos que representan al Espinal Mesopotámico. A medida que nos acercamos a los cuerpos de agua del Parque, observaremos una enorme variedad de ambientes acuáticos, característicos del Chaco Húmedo u Oriental. Esteros, bañados y los típicos embalsados, cubren tanto los pequeños riachos y lagunas como los extensos Esteros de Santa Lucía. A pesar que los mayores vertebrados de la región ya han desaparecido por la persecución humana, aún es posible encontrarse con Carpinchos, Coipos, Lobitos de Río, Monos Carayá, Yacarés, etc.

La diversidad ambiental del área permite la convivencia de una gran variedad de aves, pudiendo observar tanto las de hábitos acuáticos como las que ocupan pastizales, bosques y selvas, a pesar de la ausencia del yaguareté, el puma y el guacamayo violáceo, desaparecidos hacia principios del siglo pasado. Es de relevancia la presencia de reptiles, como el yacaré, que puede verse tomando sol en la orilla de los cursos de agua.

Esta variedad de ambientes alberga alrededor de 1.300 especies vegetales, y 319 especies de aves (que representan el 70 % de la avifauna correntina), 45 especies de mamíferos, 46 de reptiles, 26 de anfibios y 29 de peces; es el fruto de la convergencia de las tres regiones naturales. En Mburucuyá confluyen la región Paranaense, la Chaqueña y el Espinal, aportando cada una sus particularidades florísticas, y resultando del conjunto un mosaico de comunidades que le confieren al parque sus particulares características.